Muzeum české loutky a cirkusu sídlí v historickém centru města Prachatice a spadá pod národní muzeum. Společná prezentace historie loutek a cirkusového umění je v muzejním světě ojedinělá.

První část expozice prachatiského muzea loutky a cirkusu je věnována historii české loutky. Přímo v expozici je možnost shlédnout slavné inscenace loutkových her v historických divadélkách.

Druhá část patří jedinému cirkusovému muzeu v Čechách, kde může návštěvník vidět např. plakáty, fotografie, dokumenty, ale i skutečnou cirkusovéou manéž s hrazdami, perskou tyčí, jednokolkami, žonglérským náčiním a s cirkusovými kostýmy. 

Součástí muzea české loutky a cirkusu v Prachaticích je i muzejní obchod.