Zoologické oddělení existovalo již při samotném založení muzea v roce 1817. Původně jeho sbírky zahrnovaly jak obratlovce tak i bezobratlé. Od roku 1948, kdy vzniklo oddělení entomologie, jsou sběry zoologického oddělení soustřeďovány především na obratlovce.

Od počátku se oddělení svým působením zaměřuje nejen na oblast Moravy a střední Evropy, ale zároveň získávalo různými způsoby (nákupy, dary, spolupráce s dalšími organizacemi, atd.) preparáty z celého světa.

Od počátku 90. let začalo zoologické oddělení samo organizovat expedice do různých částí světa a i tímto způsobem je zoologická sbírka MZM průběžně doplňována o další vzácné přírůstky.

8. 2. 2017 – 5. 3. 2017